За версією САП, у 2015 році міністр спільно зі своїм першим заступником, який також був головою тарифної ради Міністерства інфраструктури видав наказ, який дозволяв приватним компаніям стягувати половину ставки корабельного збору із суден в морському порту Південний.
«Цей наказ було видано попри те, що акваторія морського порту Південний є державною власністю та перебуває у користуванні держпідприємства Адміністрація морських портів України і право на збори належить виключно державному підприємству. Натомість відповідно до цього наказу державному підприємству призначалась усього частина коштів, інша частина стягувалась приватними компаніями. У результаті, ДП АМПУ було завдано понад $49,63 млн збитків, що підтверджено відповідними висновками експертиз», — стверджують прокурори.
САП дії колишніх посадовців кваліфікував за ознаками злочину, передбаченого ч. 2 ст. 364 КК України (санкція статті передбачає покарання у виді позбавлення волі на строк від трьох до шести років).
Сам Андрій Пивоварський раніше докладно пояснив логіку своїх дій.
Пивоварський сказав: «Сторона звинувачення каже, що компанія, яка отримувала корабельний збір, не використала його на покращення інфраструктури порту Південний. Але сторона обвинувачення не каже, що на той момент ці кошти були заарештовані з самого початку, як вони почали збиратися. З самого моменту, як вони почали збиратися на рахунках… Були виплачені лише податки на прибуток».
Пивоварський наголосив, що наказ Мінінфраструктури, через який йому висунуто звинувачення, не було скасовано трьома міністрами поспіль, які перебували на посаді після Пивоварського.
«Сім років пройшло, наказ ніяким чином не скасований. І ніяким чином НАБУ не пішло судитися з приводу цього наказу, щоб його скасувати», — додав Пивоварський.